Con la restaurazione estense all'università si ebbe nuovamente la carica di rettore, tenuta da:
1) Paolo Ruffini - dal 1814 alla morte (1822).
In seguito si ebbero dei delegati del ministero:
2) Luigi Ponziani - (1822.1845),
3) Mario Valdrighi - (1845-1850),
4) Fortunato Cavazzoni Pederzini - (1850-1859).
Decaduto il dominio estense, si ritornò al rettorato affidato a docenti universitari proprio con Francesco Selmi. Ecco la serie dei rettori dell'università di Modena dal 1859
5) Francesco Selmi - (1859)
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| Francesco Selmi |
6) Geminiano Grimelli - (1859-1861)
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| Geminiano Grimelli |
7) Luigi Vaccà - (1861-1889)
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| Luigi Vacca' |
8) Giuseppe Triani - (1889-1895)
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| Giuseppe Triani |
9) Pasquale Melucci - (1895 1896)
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| Pasquale Melucci |
10) Giuseppe Albertotti - (1896)
11)Giuseppe Cesari - (1896-1899)
12) Giuseppe Triani - (1900-1905)
13) Giuseppe Cesari - (1905-1911)
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| Giuseppe Cesari |
14) Giuseppe Triani - (1911-1914)
15) Alessandro Coggi - (1914-1915)
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| Alessandro Coggi |
16 Pio Sabbatini - (1915-1916)
17) Pio Colombini - (1916-1932)
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| Pio Colombini |
18)Ruggero Balli - (1932-1944)
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| Ruggero Balli |
19) Carlo Guido Mor - (1944-1947)
20) Gaetano Boschi - (1947-1950)
21) Paolo Gallitelli - (1950-1954)
22) Callisto Ghigi - (1954-1955)
23) Fabio Lanfranchi - (1955-1961
24) Giuseppe Galli - (1961-1967)
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| Giuseppe Galli |
25) Lorenzo Spinelli - (1967-1969)
26) Gustavo Vignocchi - (1969-1970)
27) Giorgio Frache - (1970-1973)
28) Giuseppe Gemignani - (1973-1978)
29) Ferdinando Taddei - (1978-1984)
30) Mario Vellani - (1984 - 1993)
31) Carlo Cipolli - (1993-1999)
32) Pellacani Giancarlo (1999 - 2008)
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| Giancarlo Pellacani |
